古代に完成された自己という神話に抗して：「私たちは5万年間変わっていない」が明らかに誤りである理由

TL;DR

• 「人間はこの5万年間変化していない」という主張は、経験的に誤りである。古代DNAは、知能の代理指標、教育達成度、精神疾患リスクを含む脳関連形質に対する強い最近の選択を示している。
• ヨーロッパおよび東ユーラシアにおける多遺伝子時系列は、新石器時代以降とくに、完新世を通じて認知スコアと精神障害リスクにおける方向性のある変化を明らかにしている。
• 「脳および認知形質に関連する最近進化したバリアント」に関する新しい研究は、言語領域での濃縮と、知能および精神医学的表現型との頑健な関連を見いだしており、脳特異的進化が進行中であることを示唆する。
• Y染色体ボトルネックと性バイアスのある人口動態は、男性系統が過去8〜10千年のあいだに徹底的に淘汰・再構成されたことを示しており、行動的・社会的な相関がほぼ確実に存在する。
• Eve Theory of Consciousness（EToC）はこれを、Golden Man（自己制御システム以前）から Eve（自己言及的・精神病理的・物語的）への移行として捉える。遺伝学が今こう告げているのは、これは5万年前の一度きりの「バグ」ではなく、自己は記録された歴史にまで及ぶ継続的な改造の対象だったということだ。

併読記事: Akbari & Reich の統合失調症研究の詳細については、“Ancient DNA Shows Schizophrenia Risk Purged Over 10,000 Years” および “Holocene Minds on Hard Mode” を参照。Golden Man を制御システムとして理解するには、“Golden Man as Control System” を参照。

「人間は完成した創造物ではなく、一つの過程の始まりである。」
— ニーチェからの意訳。彼なら古代DNAを愛しただろう

1. 5万年変化なし神話#

よく耳にするフレーズがある：

「生物学的には、私たちは氷河期の人々とほとんど同じだ。進化は5万年前に止まり、それ以降はすべて文化だ。」

これはポップ進化心理学、白紙説的平等主義のレトリック、そして上部旧石器時代を「進化的適応環境」の正典として凍結させる、ある種の保守的な人類学の中に現れる。

話をコンパクトにまとめると、こうなる：

• ステップ1. 「現生的行動」が5〜7万年前ごろに出現する：芸術、装飾品、複雑な道具。
• ステップ2. この時点で脳は「完成」したと仮定され、それ以降の変化はすべて文化的なものだとされる。
• ステップ3. したがって、時代や集団間の心理的差異はすべて「単なる文化」にすぎない。

これは、みんなの人生を楽にしてくれる安心できる神話だ：

• 遺伝学者は、不愉快な行動形質について語らずに済む。
• 社会科学者は、遺伝型を一定と見なすことができる。
• 哲学者は、「人間の条件」を単一で時代を超えた対象として扱える。

問題は、この15年間の古代DNA研究が、この物語を静かに焼き払ってしまったことだ。

David Reich のグループや他の研究者たちは、過去1〜1.5万年にわたってゲノムが激しい継続的な選択を受けてきたことを示しており、その中には脳や行動に強く影響する領域も含まれる。心はラスコーで凍結したのではなく、動き続けてきたのだ。

もはや問うべきは、「人間の心理が最近進化したかどうか」ではなく、「どれだけ、どの方向に」進化したのかである。

2. 古代DNAが実際に示していること#

概念的な転換は単純だ：

以前： 「心理的形質に対する選択は見えないから、なかったと仮定しよう。」
以後： 「認知および精神医学的形質に対する多遺伝子スコアを、古代ゲノムで時空間的に追跡できる。」

私たちが今生きているのは、後者の世界だ。

2.1 Akbari ら：遍在する方向性選択#

Akbari ら（2024）は、約1.4万年にわたる数千の古代西ユーラシア・ゲノムにおいて、一貫した対立遺伝子頻度の時間的トレンドを検出することで、古代DNAにおける選択を検出する時系列手法を開発した。

その結果：

• 選択の確率 >99% の独立した遺伝子座が347箇所——これは従来のスキャンの一桁上。
• 古典的なヒット（ラクターゼ持続、色素沈着、免疫関連遺伝子座）に加え、現代のGWASで以下と関連づけられている対立遺伝子の組み合わせに対する選択を検出：
  • 統合失調症および双極性障害リスクの低下
  • 健康状態の低下の遅延
  • より高い認知パフォーマンス（IQテスト、就学年数、世帯収入）

彼らは、これらを「IQや就学年数そのもの」に対する直接選択と解釈することには慎重だ——それらは現代の表現型だからだ——しかし方向性は微妙ではない：今日の我々において、より良い認知アウトカムとより低い重度精神疾患リスクを予測するゲノム領域が、完新世において体系的に選択によって動かされてきたのである。

これは「5万年間変化なし」ではない。これは、洞窟壁画時代よりずっと後の、祖父の祖父の祖父の……深い過去において、ゲノムが調律されてきたという話だ。

2.2 Kuijpers ら：知能の多遺伝子軌跡#

Kuijpers ら（2022）は、上部旧石器時代から新石器時代後期に至るまでの約872体の古代ヨーロッパ人ゲノムを用い、身長、BMI、リポタンパク質、心血管リスク、そして一般認知能力／知能といった一連の形質について**多遺伝子スコア（PGS）**を算出した。

彼らの発見：

• 新石器時代以降、ヨーロッパ集団は、身長と知能に関する遺伝的スコアの上昇およびより明るい皮膚を示す一方で、あまり好ましくない変化（例：低HDLを介した冠動脈疾患リスクの上昇）も見られた。
• これらのトレンドは、祖先構成や遺伝的浮動を制御した後も持続しており、方向性選択を示唆する。

つまり：

• 上部旧石器時代のヨーロッパ人は、認知多遺伝子負荷において、中世や近世初期のヨーロッパ人と同一ではない。
• これらのデータセットでは、完新世を通じてGCA（一般認知能力）関連多遺伝子スコアの上昇トレンドが見られる。

これもまた「変化なし」ではない。「知能」と呼んでいるものに密接に結びついた形質の、測定可能で方向性のある進化である。

2.3 Piffer：東ユーラシアも同様#

Davide Piffer（2025）は、東ユーラシア集団について同様のことを行った。すなわち、完新世をカバーする1,245体の古代ゲノムに対して、IQ、教育達成度、自閉スペクトラム症、統合失調症などの形質に関するPGSを算出した。

要点：

• 認知および精神医学的形質のPGSにおいて、有意な時間的トレンドが見られ、方向性選択と整合的であり、単なる遺伝的浮動では説明できない。

詳細は（当然ながら）入り組んでいるが、経験的な結論は Akbari や Kuijpers と韻を踏んでいる：

• 知能および教育関連の対立遺伝子はランダムに漂っていたのではなく、長く緩やかな選択勾配に捕らえられていた。
• 統合失調症その他の精神疾患リスクは、少なくともいくつかの系統において刈り込まれてきたことと整合的なシグナルを示す。

これだけでも、凍結された自己という神話にとって致命的だ。だが、これはまだウォーミングアップにすぎない。

3. 脳は現在進行形で建設中だった#

古代の多遺伝子スコアは、「どちらの方向に」——どの形質が選好されているか——を教えてくれる。Libedinsky ら（2025）は、さらに深い問いに取り組む：

人間の脳と認知を形作る特定のバリアントはいつ出現し、それらは何をしているのか？

3.1 Libedinsky ら：最近進化した脳／認知バリアント#

Libedinsky と共同研究者たちは、以下を統合する：

• Human Genome Dating Project によるゲノム年代推定
• 知能、皮質面積、精神疾患といった形質に関する現代のGWASヒット

そして、これらの形質と関連するバリアントが過去約500万年のあいだにいつ出現したのかを追跡する。

主な発見：

• 最近の進化的変化（出現が遅い、あるいは頻度シフトが大きい対立遺伝子）を持つ遺伝子は、脳および認知形質における役割に濃縮されており、以下を含む：
• 知能（P ≈ 1.7 × 10⁻⁶）
• 皮質表面積（P ≈ 3.5 × 10⁻⁴）
• 統合失調症や双極性障害といった精神医学的表現型
• これらの遺伝子は、言語関連皮質領域での発現が高く、そこはまさに人間特有の領域である。

彼らの結論は率直だ：最近進化した遺伝的バリアントは、人間の脳、認知、精神医学的形質を形作ってきた。

これは「脳は5万年前に完成した」という話の真逆である。これは、人間の脳の配線とリスクプロファイルが、完新世に至るまで段階的にハックされてきたという、時間分解能を持った議論だ。

3.2 精神医学的遺伝子は進化の副作用#

繰り返し現れる、やや不穏なパターンがある：

• 脳および認知形質に対する選択を受けている領域は、主要な精神疾患と関連するバリアントに濃縮されている。

つまり：

• 皮質を増やし、テスト成績を向上させ、言語能力を精緻化するゲノム近傍は、統合失調症、双極性障害、自閉スペクトラム症リスクが集中する近傍でもある。

さらに、古代ウイルス配列（内在性レトロウイルス）が精神疾患と関連しているという証拠を加えると、進化の物語はきれいなものではなくなる：脳は表象能力を獲得するが、その過程で新たな故障モードを露出させる。

EToC の観点からすると、これは実に美しい：

• Eve——自己意識、物語、再帰的な罪悪感——は無料のアップグレードではない。
• それは、より豊かな認知への一歩ごとに、心が壊れうる空間を拡大してしまう、最近寄せ集められた分子機構の上に構築されている。

進化は続いており、自己の基盤そのものに対して選択がかかり続けてきたのである。

4. Y染色体ボトルネック：ギロチンにかけられた男性の心#

「最近の進化はない」という主張に対する、単独で無礼なデータポイントが欲しければ、Y染色体ボトルネックがそれだ。

Karmin ら（2015）は、全Y染色体シーケンスを用いて、地域ごとの男性有効集団サイズの時間変化を再構築した。その結果（および後続研究）は以下を示した：

• 完新世中〜後期（近東で約8,300年前、ヨーロッパで約5,000年前、シベリアで約1,400年前など地域差あり）に、男性有効集団サイズ（Ne）の大規模な世界的低下があった。
• 女性有効集団サイズ（mtDNA）は、同様のクラッシュを示さなかった。

解釈：

• これはヒト種全体のボトルネックではない。これは男性系統のボトルネックであり、多くのY系統が消滅する一方で、女性系統は拡散を続けた。
• 最も保守的な説明は、父系制社会構造、男性の生殖成功の極端な分散、おそらく戦争や社会階層化に依拠する。

何も興味深いことが男性形質に起きていなかったのに、複数大陸で男性系統が5〜10倍も淘汰されることはない。少なくとも、これは以下を意味する：

• 男性の行動表現型（同盟形成、攻撃性、規律、地位ゲーム）に対して、強烈な選択的フィルターがかかっていた。
• 多くの代替的な「男性の心の設計」は、過去1万年のあいだに繰り返し淘汰された。

Yに対する文化的 vs 生物学的選択のバランスは議論の余地があるが、それは本質ではない：男性の系譜樹は、想定される凍結時期よりはるか後に、引き裂かれ再配線されたのである。これは、自己が完成した種の姿ではない。

5. 不都合な証拠のショートテーブル#

ここまでの一部を、乱雑だが正直なテーブルにまとめてみよう。

これは網羅的ではない。最近の文献をざっと眺めただけで出てくるものだ。

共通のリフレインはこうだ：遅くまで続く、進行中の、脳に触れる進化。

6. 「完成した自己」神話が長く生き延びた理由#

これだけの証拠があるのに、なぜ今なお「私たちは5万年間変化していない」と言う人がいるのか？

いくつか理由がある：

1. 方法論的な便宜。
   長いあいだ、多遺伝子で行動的に関連する形質に対する選択は、文字通り見えなかった。多くのモデラーにとって安全な仮定は、「完新世を通じて遺伝型は一定とし、文化に焦点を当てよう」だった。それは当時は合理的だったが、今となっては怠慢だ。

2. イデオロギー上の安心感。
   静的な人間性は便利だ：

   • 進化的変化 = 序列の正当化、を恐れる平等主義者にとって。
   • 単一の普遍的EEA物語を語りたい一部の進化心理学者にとって。
   • 「堕落したが固定された」人間条件を好む神学者にとって。

3. 形態と心の混同。
   頭蓋容量や大まかな解剖学的特徴は、約10〜5万年前までにある程度安定する。それを「心も安定した」と誤読し、頭蓋形状に影響しない小さな調節変化や多遺伝子の微調整が、認知やリスクプロファイルを根本的に変えうることを無視している。

4. データの遅延。
   古代DNA研究は若い分野だ。Reich の『Who We Are and How We Got Here』が出たのは2018年であり、Akbari や Libedinsky の論文は文字通り2024〜2025年のものだ。この神話は、古代DNA以前の時代からの化石なのだ。

この時点でなお「完成した自己」物語にしがみつくには、増え続ける直接証拠を無視するしかない。

7. これが Eve Theory of Consciousness とどう噛み合うか#

Eve Theory of Consciousness は、認知的・神話的な観点からすでに以下を主張していた：

• Golden Man —— 私たちの自己以前の祖先 —— は、豊かな経験を持ちながらも、明示的で言語的に媒介された自己モデルを持たない高度な制御システムであった。
• Eve —— 自己意識的で、罪悪感に苛まれ、時間を行き来する主体 —— は、再帰的言語と内省的社会認知への選択によって構築された、最近の進化的オーバーレイである。

新しい遺伝学的データは、いくつかの点でこれと調和する：

7.1 自己は動く標的#

EToC の主張は、「1.5万年前に覚醒の瞬間があり、それで終わり」ではない。むしろこうだ：

一度、再帰的自己モデリングがいくつかの系統に現れると、それ自体が選択の標的になる。

古代DNAは、まさにこの種の動的環境を示している：

• 集団が拡大し、混ざり合い、互いを置き換える。
• 新たな生業形態（農耕、牧畜）が、計画性、協力、時間選好に対する選択圧を変える。
• 現代環境ではより良い認知パフォーマンスとより低い破局的精神疾患リスクを予測する遺伝型が選好される。

EToC の言葉で言えば：いったん Eve が登場すると、私たちは彼女を繰り返し「再繁殖」させる。異なる文化と生態は、異なる Eve たちを形作り、氷河期テンプレートのクローンを作るわけではない。

7.2 精神疾患は Eve の影#

EToC は、精神病、双極性障害、強烈な気分障害を、Eve 移行の失敗または行き過ぎとして扱う：自己モデルを安定に保てなくなった心だ。

以下の重なり合い：

• 選択を受けている脳領域
• 知能や皮質面積と関連する新規進化バリアント
• 精神疾患リスク遺伝子座

は、もし以下が真であるなら、まさに予想されるものだ：

• 自己を可能にするのと同じ神経機構が、精神病や重度気分障害も可能にする。
• これらの回路に対する進化的な押し引きは、5万年前に終わったのではなく、最近まで続いている。

Eve は安定した製品ではない。彼女は、「計画し愛するのに十分な自己」と「壊れてしまうほど過剰ではない自己」とのあいだの、生きた妥協点なのだ。

7.3 性、戦争、分岐する心#

Y染色体ボトルネックは、EToC の男女非対称性にうまくはまり込む：

• 女性系統が、社会的予測、ケア、道徳的認知（あなたの Eve）に対して一貫した選択を受けているとすれば、
• 男性系統は、同盟成功、階層的暴力、リスクテイク（あなたの青銅器時代のカイン）に応じて淘汰されているとすれば、

完新世スケールで、認知スタイル、攻撃性、情動調整における性差のある軌跡が生じるのは自然だ。

誰も、そうした軌跡をSNPリストから直接読み取れるとは考えていない。しかし、性バイアスのある人口動態と最近の脳進化のパターンは、男性と女性に利用可能な「自己のあり方」の種類が、非自明な仕方で変化してきたという物語と整合的だ。

8. 上部旧石器時代以降、実際に何が変わったのか？#

具体的にしよう。ここでの主張は、「あなたの心がクロマニョンの狩猟採集民には理解不能だ」ということではない。心の分布と故障モードが変わった、ということだ。

完新世におけるもっともらしい変化には、以下が含まれる：

• 抽象的・形式的推論能力の平均的な向上（学校教育、法、複雑な技術）

  • 複数地域で、知能／教育達成度PGSの上昇トレンドが見られることに支えられている。

• 破局的な精神病や気分障害のリスク

  • 特定の系統では、最悪の統合失調症／双極性障害負荷が刈り込まれてきたように見える一方で、新たなリスク構造も出現している。

• 行動表現型の分散における性差

  • 男性の生殖成功の極端な分散と父系制社会構造は、特定の男性的認知／行動スタイルを増幅し、他を消滅させた可能性が高い。

• 時間選好、衝動制御、同盟行動

  • 農耕、所有、複雑な国家は、より長い計画ホライゾンとルール遵守を報いる。こうした形質を十分に産出できなかった集団は不利だった。教育達成度の多遺伝子トレンドは、ここでのもっともらしい代理指標である。

これらすべては、同じ基本的なホモ・サピエンスのハードウェアの上に乗っている。しかし、ハードウェアは運命ではない。調節ネットワークや対立遺伝子頻度の小さな変化が、心の統計的風景をシフトさせる。

あなたはいまだに、Golden Man の制御システムを走らせている類人猿だ。だが、最も緩やかで曖昧な意味を除けば、4万年前のオーリニャック文化の狩人と「同じ」類人猿ではない。

9. なぜこれは重要なのか（オタク的満足以上の意味で）#

これは、学会で人をイラつかせるための「実はね」ではない。実際に意味を持つ。

1. 「人間性」の再定義。
   人間性は固定点ではなく、軌跡である。それを凍結されたものとして扱うことは、20世紀の無知を前提にしてしまう。脳の遺伝的アーキテクチャが動いてきたと認めれば、より賢く「どのように、なぜ」を問うことができる。

2. 単純な文化決定論を切り崩す。
   文化は非常に重要だ。同様に、選択史の違いも重要だ。心理的変異のすべてを「単なる文化」とする主張は、粗雑な遺伝決定論と同じくらい非科学的であり、古代DNAはその最後の言い訳を取り上げてしまった。

3. 精神疾患を真剣に扱うことを迫る。
   もし現代的自己を可能にする回路が最近のもので脆弱なら、統合失調症、双極性障害、重度うつ病といった状態は、ランダムなバグではなく、深い進化的トレードオフである。それは、スティグマ、治療、予防をどう考えるかに影響すべきだ。

4. EToC のような理論に余地を与える。
   静的な脳の世界には、自己が完新世に出現するという Eve 理論的な物語の入り込む余地はない。動的な脳の世界にはある。EToC を受け入れる必要はないが、「意識には歴史がある」というその基本的な賭けが、5万年前凍結の御伽話よりも遺伝学データとよく噛み合うことは認めざるをえない。

5. 未来形を取り戻す。
   もし私たちの心が1万年で変わったのなら、自然選択と意図的な遺伝的／技術的介入の両方を通じて、次の1万年でも変わるだろう。私たちは「最終形態」ではない。シーズン途中のパッチにすぎない。

FAQ#

Q1. これは、地域ごとに根本的に異なる「自己」があるという意味か？
A. これは、異なる集団が脳関連形質に対して部分的に異なる選択史を持つという意味だ。それは統計分布をシフトさせうるが、別々の「自己の種」を作るわけではない。集団内変異は依然として巨大だ。しかし、まったく選択がなかったと装うことは、もはや擁護不能である。

Q2. 古代DNAにおける多遺伝子スコアはどれくらい確かか？
A. それらはノイズが多く、現代のGWASに依存しているが、複数の独立したチーム（Kuijpers, Akbari, Piffer ほか）が異なるデータセットと手法を用いて、主要形質について似た方向性トレンドに収束している。これは、真の選択がある場合にまさに期待されることだ。

Q3. これらのシグナルはすべて、たまたま認知形質とSNPを共有する非認知形質に対する選択にすぎないのでは？
A. 多面発現（プレオトロピー）は確実に関与している——だが、それは「変化なし」主張の救済にはならない。もし網がつながっているなら、一部（例：疾患抵抗性）を引っ張れば、認知や精神疾患リスクも一緒に動く。心はその網の上に乗っている。

Q4. 進化は5万年前ではなく20万年前にほぼ終わった、という可能性は？
A. いいえ。現在の最良の証拠は、とくに食事、免疫、色素沈着、身長、認知、精神疾患リスクに関して、完新世に至るまで有意な進化が続いてきたことを示している。正確なタイムラインは今後も精緻化されるだろうが、進行方向は明らかだ：進化は決して止まっていない。

出典#

1. Akbari, A. et al. “Pervasive findings of directional selection realize the promise of ancient DNA to elucidate human adaptation.” Preprint / in review, 2024.
2. Kuijpers, Y. et al. “Evolutionary Trajectories of Complex Traits in European Populations of Modern Humans.” Frontiers in Genetics 13 (2022): 833190.
3. Piffer, D. “Directional Selection and Evolution of Polygenic Traits in Eastern Eurasia: Insights from Ancient DNA.” Preprint, 2025.
4. Libedinsky, I. et al. “The emergence of genetic variants linked to brain and cognitive traits in human evolution.” Cerebral Cortex 35(8) (2025): bhaf127.
5. Karmin, M. et al. “A recent bottleneck of Y chromosome diversity coincides with a global change in culture.” Genome Research 25 (2015): 459–466.
6. Guyon, L. et al. “Patrilineal segmentary systems provide a peaceful explanation for the post-Neolithic Y-chromosome bottleneck.” Nature Communications (2024).
7. Heyer, E. et al. “Sex-specific demographic behaviours that shape human genetic variation.” Molecular Ecology 21 (2012): 597–612.
8. Scientific Inquirer. “Ancient viral DNA in the human genome linked to major psychiatric disorders.” May 23, 2024.
9. Reich, D. Who We Are and How We Got Here: Ancient DNA and the New Science of the Human Past. Pantheon, 2018. (See also his public talk on ancient DNA and human history.)
10. Cutler, A. “Holocene Selection on Human Intelligence.” SnakeCult.net (2025).