Haplogroupe A00 du Chromosome Y : Introgression Archaïque ou Lignée Humaine Profonde ?

TL;DR

• Haplogroupe A00 est la lignée de chromosome Y humain la plus ancienne connue, se séparant des autres lignées humaines il y a environ 200 000 à 300 000 ans.
• Sa découverte en 2013 a considérablement repoussé l’âge estimé de notre ancêtre paternel commun le plus récent (“Adam Y-chromosomique”).
• A00 se trouve aujourd’hui chez un petit nombre d’individus du peuple Mbo de l’ouest du Cameroun.
• Son âge extrême a conduit à deux principales hypothèses :

1. C’est un vestige d’une population archaïque “fantôme” inconnue qui s’est croisée avec les premiers Homo sapiens en Afrique.
2. C’est simplement une lignée très ancienne d’une population ancestrale de Homo sapiens structurée qui est restée isolée pendant une longue période.

• Bien que l’idée de la “population fantôme” soit plausible et corresponde à d’autres preuves génétiques, la plupart des chercheurs penchent actuellement pour A00 comme étant une partie ancienne mais intégrale de la diversité humaine.

La Découverte Choquante d’une Lignée Fantôme#

La découverte de l’haplogroupe Y A00 a provoqué des ondes de choc dans la communauté génétique. Identifiée en 2013, cette lignée d’ADN-Y s’est révélée être la branche la plus ancienne de l’arbre généalogique paternel humain. Son âge extrême et sa rareté ont soulevé des questions fascinantes sur les origines humaines précoces.

L’haplogroupe A00 a été mis en lumière grâce à une combinaison de généalogie génétique et de recherche académique. En 2012, des scientifiques dirigés par Fernando Mendez et Michael F. Hammer ont analysé le chromosome Y d’un homme afro-américain (plus tard retracé au groupe ethnique Mbo de l’ouest du Cameroun) et ont trouvé quelque chose d’inédit.¹ Ce chromosome Y ne portait aucune des mutations habituelles qui définissent les haplogroupes Y humains connus – en d’autres termes, il occupait le nœud le plus profond de l’arbre chromosomique Y. Mendez et al. ont officiellement rapporté cette “nouvelle lignée” au début de 2013 et l’ont baptisée haplogroupe A00, indiquant une branche encore plus ancienne que la racine “A0” antérieure de l’arbre.¹

Les chercheurs ont été stupéfaits par l’estimation de l’âge de A00. Basé sur les mutations de l’ADN (en utilisant une horloge moléculaire), Mendez et al. ont calculé que A00 s’est séparé de tous les autres chromosomes Y des hommes vivants il y a environ 338 000 ans (avec un intervalle de confiance d’environ 237 000 à 581 000 ans).¹ Ce timing est extraordinaire – il précède les fossiles les plus anciens connus d’humains anatomiquement modernes (~195–200 mille ans) de plus de 100 000 ans. Comme l’a noté le Dr Hammer, “notre analyse indique que cette lignée a divergé… à une époque où les humains anatomiquement modernes n’avaient pas encore évolué”.² Cela fait de A00 une lignée véritablement basale dans notre espèce.

Il est important de noter que l’haplogroupe A00 n’a pas été identifié dans des restes anciens, mais chez des personnes vivantes. Après la découverte initiale, les chercheurs ont trouvé 11 hommes d’une petite région de l’ouest du Cameroun (peuple Mbo) portant des chromosomes Y appartenant à A00.¹

A00 comme la Plus Ancienne Lignée Basale Humaine Y#

La position de l’haplogroupe A00 à la base de l’arbre généalogique du chromosome Y signifie qu’il est le plus éloigné de toutes les autres lignées Y connues. Tous les autres hommes (qu’ils soient dans l’haplogroupe A0, B, C, D, E, etc.) partagent des mutations que A00 n’a pas, ce qui signifie qu’ils partagent un ancêtre commun plus récent entre eux qu’avec A00.

En raison de A00, les estimations de l’âge de “l’Adam Y-chromosomique” (l’ancêtre commun le plus récent de toutes les lignées mâles vivantes) ont dû être révisées de manière significative. Des recherches ultérieures ont convergé vers un âge encore ancien d’environ 200 000 à 300 000 ans, chevauchant la période où les premiers Homo sapiens émergeaient en Afrique.³⁴ Même avec ces dates révisées, A00 reste la lignée de chromosome Y la plus ancienne connue de loin.

Figure : Arbre simplifié du chromosome Y illustrant la divergence profonde de l’haplogroupe A00 de toutes les autres lignées Y humaines modernes. L’analyse initiale a suggéré une séparation ~338kya, tandis que des estimations ultérieures ont révisé cela à ~200-300kya.¹³

L’Hypothèse de la “Population Fantôme”#

Ce chromosome Y pourrait-il avoir une origine en dehors de Homo sapiens ? Une idée provocante est que A00 pourrait être entré dans notre pool génétique via un croisement avec un homininé archaïque, maintenant éteint – une “population fantôme” qui s’est séparée de nos ancêtres il y a longtemps. Mendez et al. ont explicitement soulevé cette possibilité.¹

L’idée est analogue à la façon dont les personnes non africaines portent aujourd’hui de petites fractions d’ADN néandertalien ou dénisovien. Dans ce cas, le croisement aurait eu lieu en Afrique entre les premiers humains modernes et un groupe archaïque mystérieux qui n’a laissé aucun fossile connu.

Cette idée est soutenue par d’autres preuves génétiques. Par exemple, une étude de 2020 a conclu que certaines populations d’Afrique de l’Ouest ont hérité de 2% à 19% de leur ADN d’un homininé archaïque encore inconnu qui a divergé de la lignée humaine même avant les Néandertaliens.⁵ L’haplogroupe A00 est souvent mentionné comme un cas potentiel de tel mélange archaïque.⁶

Alors, A00 pourrait-il être une lignée non-Homo sapiens ? La réponse courte est peut-être – mais cela reste non prouvé. Nous n’avons pas trouvé d’échantillon d’ADN ancien provenant d’un fossile d’un mâle archaïque portant A00. Tous les exemples connus proviennent de Homo sapiens vivants.

Alternative : Un Passé de Homo sapiens Profondément Structuré#

Une interprétation plus conservatrice est que l’haplogroupe A00 représente simplement une branche extrêmement ancienne au sein de Homo sapiens. Des recherches récentes suggèrent que la population africaine ancestrale n’était pas une unité cohésive unique, mais une “métapopulation” avec des branches qui se séparaient et se rejoignaient par intermittence sur des centaines de milliers d’années.⁷

Dans ce modèle, certaines lignées génétiques pourraient être devenues très profondément séparées tout en appartenant encore à notre espèce, et plus tard réintégrées lorsque les sous-groupes se sont fusionnés. Cela ferait de A00 une lignée indigène de Homo sapiens qui est simplement restée séparée plus longtemps que d’autres. Les chercheurs ont trouvé que ce modèle pourrait expliquer la présence de différences génétiques très anciennes “sans invoquer de fantômes”.⁷

Il est également utile de se rappeler que des termes comme “archaïque” et “moderne” pour les humains sont quelque peu fluides à l’époque où A00 a vu le jour. La frontière entre un Homo heidelbergensis tardif et un Homo sapiens précoce pourrait ne pas avoir été nette.

Conclusion : Une Fenêtre sur Nos Racines Enchevêtrées#

L’haplogroupe A00 est sans équivoque la lignée de chromosome Y la plus ancienne trouvée chez les humains vivants. La question centrale est pourquoi elle est si divergente. Deux grandes interprétations existent :

• Lignée Humaine Basale : A00 est une branche précoce et isolée de notre propre espèce, reflétant une structure de population complexe dans l’Afrique ancienne.
• Introgression Archaïque “Fantôme” : A00 est un vestige génétique d’un homininé archaïque inconnu qui s’est croisé avec nos ancêtres.

À l’heure actuelle, il n’y a pas de preuve définitive en faveur d’une explication. De nombreux chercheurs penchent vers l’interprétation plus simple que A00 est une lignée de Homo sapiens inhabituellement profonde.³ Cependant, l’hypothèse de la population fantôme ne peut être écartée. A00 reste un exemple profond de combien nous avons encore à apprendre sur nos origines, nous rappelant que les racines de l’arbre généalogique humain sont enchevêtrées et anciennes.

FAQ#

Q1. Qu’est-ce que l’Haplogroupe A00 ? A. L’haplogroupe A00 est la branche la plus ancienne et la plus divergente de l’arbre généalogique du chromosome Y humain trouvée chez les personnes vivantes aujourd’hui. Ses porteurs sont les plus éloignés dans la lignée masculine de tous les autres hommes sur Terre.

Q2. Quel âge a l’Haplogroupe A00 ? A. La lignée est estimée s’être séparée de toutes les autres lignes de chromosome Y humain il y a environ 200 000 à 300 000 ans, repoussant considérablement l’âge de notre ancêtre commun paternel.

Q3. Où se trouve l’Haplogroupe A00 ? A. Jusqu’à présent, il n’a été identifié que chez un petit nombre d’individus du groupe ethnique Mbo dans l’ouest du Cameroun et chez certains Afro-Américains ayant des ancêtres de cette région.

Q4. Quelle est la théorie de la “population fantôme” pour A00 ? A. Cette théorie propose que A00 n’a pas son origine dans Homo sapiens, mais a été transmis à nos ancêtres par un croisement avec une espèce humaine archaïque “fantôme”, maintenant éteinte, en Afrique pour laquelle nous n’avons aucune preuve fossile.

Q5. Est-il plus probable que A00 provienne d’une population fantôme ou simplement d’une ancienne lignée humaine ? A. Bien que l’idée de la population fantôme soit intrigante, de nombreux scientifiques pensent qu’il est plus probable que A00 soit une lignée très ancienne au sein de Homo sapiens qui a survécu grâce à des structures de population complexes et à une isolation à long terme dans l’Afrique ancienne.

Notes de bas de page#

Sources#

1. Mendez, Fernando L. et al. “An African American Y Chromosome Cradles the Deepest Root of the Human Y Chromosome Phylogeny.” American Journal of Human Genetics 92.3 (2013): 454-459.
2. Elhaik, Eran et al. “The ‘Extremely Ancient’ Chromosome that Isn’t: A Forensic Bioinformatics Approach.” European Journal of Human Genetics 22.9 (2014): 1111-1116.
3. Karmin, Monika et al. “A Recent Bottleneck of Y chromosome Diversity Coincides with a Global Change in Culture.” Genome Research 25.4 (2015): 459-466.
4. Hawks, John. “A00 and the African ‘superarchaic’.” John Hawks Weblog, 2019.
5. Vernimmen, Tim. “A new origin story for our species.” National Geographic, 2023.
6. “Y-Chromosomal Adam, the Common Male Ancestor of All Living Men, Lived 338,000 Years Ago.” Sci-News, 2013.
7. “Ghost Archaic Hominin Lineage Contributed to Genomes of Modern West Africans, Study Suggests.” Sci-News, 2020.